水泥粉尘会损害肺部健康，损伤皮肤，引起全身中毒。粉尘随呼吸进入肺部，可在肺组织内反应为异物，形成以肺纤维化为主的疾病，即尘肺病的一种。进入支气管还会导致全身中毒，附着在皮肤上会损伤皮肤。
水泥粉尘很容易随呼吸进入肺部，进入肺部后可在肺组织内反应为异物，导致肺组织纤维化。由于吸入粉尘的质量和数量不同，危害程度也不同。通常，粉尘引起的肺部疾病统称为尘肺病，种类繁多，其中12种被列为职业病。
水泥粉尘容易粘在皮肤上。如果长期处于这种环境中，皮肤会一直受到灰尘的刺激，出现痤疮、毛囊炎、脓皮病等。就会形成。不小心进入眼睛还会造成角膜损伤，导致角膜暗沉，角膜混浊。
水泥粉尘含有有害物质，如铅、铜、锌、锰等有毒物质。吸入人体后，可被支气管壁溶解吸收，随血液带到全身各部位，引起全身中毒。铅中毒是慢性的，饮用后可引起急性中毒，体内铜含量过高可引起溶血性贫血。
