碳源是微生物生长一类营养物，是含碳化合物。碳源是指二氧化碳气体成分从地球表面进入大气或者在大气中由其他物质经化学过程转化为二氧化碳气体成分。
把从外界吸入的氮素化合物或氮气，称为该生物的氮源。
C/N中，C代表碳元素，N代表氮元素。
碳素是堆肥微生物的基本能量来源，也是微生物细胞构成的基本原材料，堆肥微生物在分解含碳有机物的同时，利用部分氮元素来构建自身的细胞体，氮还是构成细胞中蛋白质、核酸、各种酶类的重要成分，一般情况下微生物每消耗25g有机碳，需要吸收1g氮素，微生物分解有机物比较适宜的碳氮比为25左右，C/N过高，微生物生长繁殖所需的氮元素受到限制，微生物繁殖速度低，有机物分解速度慢，发酵时间长，堆肥腐殖化系数低，堆肥发酵不好。C/N过低，微生物生长繁殖所需的能量来源受到限制，发酵温度上升缓慢，氮过量并以氨气的形式释放，有机氮损失大，还会散发难闻的气味。因此合理调节堆肥原料的碳氮比，是加速堆肥腐熟的有效途径。
有机肥发酵过程中物料成分的调节很重要，其中最关键的影响因素是水分、透气性、物料的碳氮比，水分要调节到50-60%，透气性要良好，碳氮比最好在25-30之间。
猪粪含水量较大70%左右，C/N比20左右。
这类原料以猪粪为代表，含氮量较高但含水量大，含有较多的腐殖质，对提高土壤肥力有很好的作用；其水分含量和C/N取决于是否使用垫料、垫料的类型和数量、管理方式养殖方法以及气候等，通常臭味重。
有机肥腐熟后碳氮比10-15左右。
是严格厌氧的细菌，它的碳源是二氧化碳。
请参考下列资料，
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硝化菌是自养菌,就是以二氧化碳为碳源的,不能以有机物为碳源，少量硝化菌是兼性厌氧的可以以有机物为碳源。
酵母菌的碳源包括糖类、蛋白质、一些有机酸等含碳有机物。
乳酸菌的碳源主要为单糖中的己糖，部分菌种能利用戊糖，只有极少数菌种能利用淀粉。
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