1、背景不同
资本主义萌芽产生于明朝中后期，处于封建社会内部，由于社会分工扩大，使各自的生产品成为商品，而扩大着交换的范围。民营手工业作坊增多，市场比较繁荣，白银流通和货币关系也得到发展。这些都说明是商品经济发展的必然结果。
而民族资本主义产生于半殖民地半封建社会内部，是在外商企业的刺激，洋务运动的诱导，外国资本主义的侵入,加速了自然经济解体的前提下，直接从外国输入机器、技术创办起来的。
2、生产方式不同
资本主义萌芽处于状态，采用手工操作；而民族资本主义处于机器大生产时期，采用机器生产。
3、规模和分布不同
资本主义萌芽一般规模小，主要集中在江南的个别地区、个别行业、个别部门；而民族资本主义通常规模较大，分布于沿江和沿海地区。
4、管理者不同
资本主义萌芽时期，手工工场的管理者是富裕起来的手工作坊主，即“出资”的机户；而民族资本主义企业的管理者是一些官僚、地主和商人转化的民族资产阶级。
5、劳动者不同
资本主义萌芽时期的劳动者是早期的工人，即掌握熟练技术的“出力”的机工；而民族资本主义企业的劳动者是工业无产阶级，即来自破产的农民。
6、发展面临的问题不同
资本主义萌芽的发展主要障碍是腐朽落后的封建制度和自然经济。而民族资本主义“先天”资金短缺、市场狭窄、技术力量薄弱、劳动力素质低，“后天”又遭到外国资本主义与本国封建主义的双重压迫。
7、所表现的特点不同
资本主义萌芽只是处于工场手工业时期，且发展缓慢；而民族资本主义得到了几次发展的机会，并出现了短暂的春天。
8、影响不同
资本主义萌芽的出现，表明在封建社会内部已经产生了一种新的社会生产关系，是封建制度衰落的标志和具体体现之一。
而民族资本主义的产生和发展，使中国的经济结构和阶级结构发生了变化。推动了中国近代化的进程和社会经济的发展，为中国革命的发展和转变提供了物质条件，也为西方资本主义思想文化的传播提供了社会基础。
参考资料来源：百度百科-中国资本主义萌芽
参考资料来源：百度百科-中国民族资本主义
重农抑商政策在封建社会初期,对农业、对社会经济的发展、对新兴地主阶级政权的巩固都起到了积极作用
到了封建社会末期,在生产力发展,商品经济活跃、资本主义萌芽产生后,坚持重农抑商政策,把商、农发展对立起来就违反了经济发展的规律,对经济发展起到了阻碍作用
资本主义萌芽的出现,是明清社会经济发展中的新现象明朝中后期,资本主义萌芽首先在手工业生产部门出现到清朝中期,资本主义萌芽得到发展这期间经历了曲折的道路,发展十分缓慢所谓的资本主义萌芽是指“处在萌芽状态的雇佣关系”,它的发展方向是资本主义所以,毛泽东在《中国革命和中国***》中说：“中国封建社会内的商品经济的发展,已经孕育着资本主义的萌芽,如果没有外国资本主义的影响,中国也将缓慢地发展到资本主义社会”资本主义萌芽在中国和西欧几乎是同时出现的然而,它们的命运却戳然不同在西欧,资本主义萌芽迅速发展、壮大,强有力地推动着自己的国家冲破封建牢笼,步入近代社会的门槛在中国,资本主义萌芽终究难以冲破自然经济的藩篱原因何在资本主义能在西欧腾飞,得力于重商主义的推行,而重商主义是资本主义工业社会发生发展的历史前提资本主义萌芽在中国不断遭受摧残,要归罪于重农抑商政策重农抑商政策在明清两代表现形式多种多样如明清两代屡次颁布禁海令,严禁人民私自出海贸易明神宗派宦官充当矿监税使,在工矿业发达地区、广设关卡,处处征税清朝在全国城镇、交通要道,遍设税局,征税范围几乎包括全部生活用品和生产资料明政府还建立岁办和采办制度来盘剥商人由于从事工商业必须承担风险,封建地租、高利贷就有更大吸引力在明清两代,那些徽商、晋商发财以后,都广置田地,开办当铺,认为田地是最可靠的产业,放高利贷可以安坐获益这就大大阻碍着社会财富向产业资本转化,困而限制了资本主义的成长
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解析:
我想作一点浅薄的分析：
中国的资本主义萌芽萌发于明末清初之际，在江南，我可以问一个问题，为什么是产生于南方而不是北方，为什么是产生于明末清初而不是隋唐呢？
对待这样的一个问题，我们不能只局限于江南，要放眼整个中国，甚至是全球，要用全面的、联系的观点看问题，这是必需的。
明确这些问题后，我就作一些分析了。
中国自炎黄时期，开发最早的是北方，尤其是各个大河流域，黄河流域及其支流，是整个中华民族的摇篮，至夏商周时期，我们便是世界四大文明古国之一了，因此，自中国的远古时代起，北方就是中华民族的经济中心，而南方，尤其是水丰土沃的江南则开发的较晚，这样就造成了一个问题，自古中国的政治中心依附于经济中心，北方就深受政治的影响，封建经济、政治十分发达，在此基础上的封建文化也是格外繁荣，而南方呢？受这种影响较小，由于历史上中国几次的分裂时期，多源于各个民族的战乱，又多发生于北方，因此，在中国的历史上有几次大规模的人口迁移，南北方人口逐渐趋于平衡，北民南迁，带去了人口和人才，还有技术，因此南方渐渐被开发，经济重心渐南移，继隋唐繁荣，中国的封建政治经济文化到达顶峰后，中国的封建政治渐趋衰败，尤其是北方，至两宋，经济重心转移到南方，尽管依然是封建经济，但是，确是受封建影响较轻的经济，这就是后来的“伏笔”。
南方，这是一方与众不同的水土，“小桥流水人家”细腻轻柔，这又是不同于北方的自然环境。
不同的社会和自然环境，孕育了不同的思想，不同的人，不同的经济形式，北方的那种“重农轻商”的经济思想、“以农为本‘的经济形式，在这里影响较轻。
多年的人口迁移，多年的开发，多年的经济、思想的积累，在时机成熟时，便会产生新的东西，明末清初，封建经济已腐朽的一定的程度，反映到文化上，就是出现了一批反封建君主的思想家，如顾炎武、王夫之、黄宗羲等，历史到了这样的时代，就会理所当然的催生出一点有活力的东西，这是必然，产生了一种新的东西——资本主义萌芽，此时的西方世界，也在发生的新的变化：新航路的开辟、文艺复兴、宗教改革等，也在孕育着新的东西——资产阶级革命。
不过，中国的资本主义萌芽渐渐被腐朽的封建政治经济压下去，发展举步为艰啊！至鸦片战争时，始终未能有大的突破，战争起，西方殖民者的入侵，与中国的旧东西结合，萌芽的命运就改变了。
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