CpG岛（CpG islands）是指DNA上一个区域，此区域含有大量相联的胞嘧啶（C）、鸟嘌呤（G），以及使两者相连的磷酸酯键（p）。哺乳类基因中的启动子上，含有约40%的CpG岛（人类约70%）。一般CpG岛的长度约300到3000个碱基对（bp）。
常用的正式定义是指一个至少含有200bp的区域，其中GC所占比例超过50%，且CpG的观察值／预测值比例必须高于06。此霸部份的CpG岛与基因相连，可用来作为限制酶的辨识位置。
CpG表示核苷酸对,其中G在DNA链中紧随C后CpG对很少出现在人类基因中。然而，在许多基因的启动子（promotor）或转录起始位点（transcription
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site，TSS）区域周围，甲基化经常被抑制。这些区域包含浓度相对较高的CpG对，与染色体一起称作CpG岛，其长度通常在几百到几千核苷酸的长度内变化。
CpG岛(CpG island)：CpG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一，而在基因组的某些区段，CpG保持或高于正常概率，这些区段被称作CpG岛,在哺乳动物基因组中的1~2kb的DNA片段，它富含非甲基化的CpG双倍体。CpG岛主要位于基因的启动子和第一外显子区域，约有60％以上基因的启动子含有CpG岛。GC含量大于50%,长度超过200bp CpG岛经常出现在真核生物的house-keeping基因的调控区，在其它地方出现时会由于CpG中的C易被甲基化而形成5'-甲基胞嘧啶，脱氨基后形成胸腺嘧啶，由于T本身就会存在于DNA中，因此不易被修复，所以被淘汰。故CpG在基因组中是以岛的形式分布的。 CpG表示核苷酸对，其中G在DNA链中紧随C后。CpG对很少出现在人类基因中。然而，在许多基因的发起者（promotor）或“开始”区域周围，甲基化经常被抑制。这些区域包含浓度相对较高的CpG对，与染色体一起称作CpG岛，其长度通常在几百到几千核苷酸的长度内变化。
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