包括年级不同：
人教版PEP是小学三年级开始到小学毕业使用的。
2人教版是包括所有年级。
人教PEP是人民教育出版社出版的一种英语教材，这种教材是供三年级起始用的，PEP是初等的、小学英语的学生书。
人教版包括PEP版。
扩展资料：
人教版即由人民教育出版社出版，简称为人教版。小学到高中都有这个版本的教材。也是大多数学校所用的教材。
“人教版”一般是就教科书意义而言的，是相对于其他出版社出版的教科书而言的。如长春出版社出版的教科书称为“长春版”、广东教育出版社出版的教科书称为“粤教版”、上海教育出版社出版的教科书称为“沪教版”。可见所谓“人教”指的是“人民教育出版社”，所谓“版”指的是教科书版本，而非“出版社”的“版”。
因此，“人教版”指的是由人民教育出版社出版的教科书版本。比如我国中小学教育辅导报刊中，《语文报》、《中学生学习报》、《学苑新报》等均有着不同版本的教辅报纸，诸如人教大纲版、人教新课标版等。这两个版本名称均是配合由人民教育出版社出版的教科书的报纸，是新课改前后的版本名称。随着新课改的深入，前者逐渐退出历史舞台，后者便统一称为人教版。本套教科书是由课程教材研究所与xx（科目）课程教材研究开发中心编著，由新华书店集团发行。
参考资料：
人教版-百度百科
一、使用年级不同
1、人教版PEP是小学三年级开始到小学毕业使用的。
2、人教版是包括所有年级。
二、两者版本不同：
这两个版本名称均是配合由人民教育出版社出版的教科书的报纸，是新课改前后的版本名称。随着新课改的深入，前者逐渐退出历史舞台，已经很少使用和出现了。
后者便是为了统一称为人教版。
三、教材的难易程度不同
PEP小学英语三年级起点，是人民教育出版社出版的教学作品，以精彩的动画故事、童谣歌曲，生动地展现了语言情境，让孩子看得愉快，学得轻松。
人教版的则是从一年级到高中都有教材，贯穿整个学习生涯，难易程度则是从易到难。
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