有区别。主要区别有，科目分类不同、形态特征不同、生活习性不同，具体如下：
一、科目分类不同
1、变色龙
学名避役，俗称变色龙。属蜥蜴目、避役科、避役属。
2、蜥蜴
学名蜥蜴，俗称四脚蛇、蛇舅母。属蜥蜴目、蜥蜴科、蜥蜴属。
二、形态特征不同
1、变色龙
体长多15～25公分），最长者达60公分。身体长筒状，两侧扁平，头呈三角形，尾常卷曲。眼凸出，两眼可独立地转动。某些种类的头呈盔形，有的种类有显目的头饰，如3个向前方伸出的长角等。
2、蜥蜴
蜥蜴类动物身体一般分为头、颈、躯干、尾4个部分。身体表皮为革质鳞，有些种类在鳞下还有小骨板，牙齿细小，舌的形状、长短随品种而异。眼睛较发达，有些种类还有颅顶眼，除多数壁虎外眼睑多能运动，穴居类型的眼睛多隐于皮下。其耳，鼓膜多显露，鼓膜发达。左右下颔骨以骨缝相联合，因此，口不能张开过大。多数蜥蜴有四肢，但有的只有前肢或后肢，指、趾末端有爪。有胸骨。
三、生活习性不同
1、变色龙
变色龙多出现在雨林至热带大草原，有些则在山区，在寒冷的大草原则很罕见，而且绝对栖息於树上。变色龙最拿手的绝活儿就是变色。它皮肤的基本颜色是绿色,但它可以随时变出深绿、浅绿、紫、蓝、褐色等,甚至可以变出各色相间“花里胡哨”的花纹色。大多数种类是卵生，到地上产卵，卵埋在土里或腐烂的木头里。
2、蜥蜴
蜥蜴生境各异，生活于地下、地表或高大的植被中，沙漠及海岛中均可见。对蜥蜴最为重要的环境因素为温度，许多种有其最适温度，会晒太阳以升高体温，使之高于气温。生活于寒冷地区的种冬眠。昼长对蜥蜴亦有影响。大部分蜥蜴为卵生，卵产于所挖穴中，树木、岩石的裂缝中，或落叶层下。
参考资料来源：百度百科-变色龙
参考资料来源：百度百科-蜥蜴
如下：
1、名词包含范围不同。变色龙是蜥蜴的一种；而蜥蜴是有鳞目蜥蜴亚目内爬行动物的总称。
2、特征不同。变色龙具有体色随环境变化的能力；而蜥蜴中，除了变色龙与安乐蜥，其他蜥蜴无法改变体色特征。
3、分布地区不同。变色龙主要分布在非洲地区，少数分布在亚洲和欧洲南部，其中在马达加斯加居住的种类占一半左右；而蜥蜴在世界各地均有分布，大多分布在热带和亚热带，其生活环境多样。
4、栖息方式不同。变色龙主要为树栖生物；蜥蜴主要是陆栖，也有树栖、半水栖和土中穴居。
变色龙的分布
变色龙：避役科爬行类，产于东半球，主要树栖。特征为体色能变化。每2～3趾并合为二组对趾、端生牙，舌细长可伸展。鬣蜥科的安乐蜥产于西半球，亦称为假避役。其中约有一半的种仅分布在马达加斯加，其他大部分分布在撒哈拉以南的非洲。
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