主要区别是，性质不同、任职条件不同、特点不同，具体如下：
一、性质不同
1、牧师
牧师是基督教的宗教职位。
2、神父
神父是罗马天主教和东正教的宗教职位。
二、任职条件不同
1、牧师
女性亦可以成为牧师。
2、神父
只有男性修士才可担当此职位。
三、特点不同
1、牧师
牧师可以结婚。
2、神父
拉丁礼天主教的神父终身不可结婚，而东正教的白衣神父可以在晋铎前结婚，但主教只能在独身者中挑选。
参考资料来源：百度百科-牧师
参考资料来源：百度百科-神父
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