关键基因筛选(通过“关键词”查找)
解决方案:数据“筛选”功能
通过“数据”菜单栏下的“筛选”功能可以对每列实现自动筛选功能,点击在表格第一行右下角的下拉箭头,可以出现文本筛选,输入关键词,即可筛选出感兴趣的关键基因。需要对每列都进行筛选。
问题二:关键基因相关数据整合(整合不同表格中的数据)
解决方案 :Vlookup函数
VLOOKUP是一个查找函数,给定一个查找的目标,它就能从指定的查找区域中查找返回想要查找到的值。所有的测序项目中,数据分析时的基因名称或ID都是唯一的,正好完美地匹配了vlookup函数的要求,以保证数据匹配的唯一性。
它的基本语法为:
=VLOOKUP(查找目标,查找范围,返回值的列数,精确OR模糊查找)
第一个参数(查找目标)必须是数据中的唯一匹配项,如果不唯一,返回值会自动匹配为第一个找到的数据结果;
第二个参数(查找范围)可以在同一个文件,也可以跨文件查找,但必须是以包含第一个参数的利作为起始列,可以选择列,也可以选择固定区域;
第三个参数(返回值的列数)必须是整数,是待匹配数据在查找范围区域的第几列;
第四个参数(精确OR模糊查找),精确即完全一样,模糊即包含的意思,小编通常默认为0
匹配上第一个数后,选中该单元格,待右下角出现“+”时,双击或下拉即可完成所有数据的匹配项。
问题三:关键基因数据汇总(数据汇总统计)
解决方案:1、数据透视表(简单)
2、函数:countif sumif (难度高)
3、函数:数据“筛选”功能(简单+模糊搜索)
1、数据透视表(简单)
Excel自带的智能数据统计功能,掌握这一技能足以让你在数据分析中事半功倍。该功能嵌入在“插入”菜单下的“数据透视表”,可以选择一个sheet下分析,也可以选择新建工作表进行分析,因测序数据一般涉及的数据较多,很难一个页面全部展现,因此推荐在新建的工作表中进行。
具体操作如下:
操作时仅需要将右上方的字段拖拽到下方的表格内即可,可以选择合适的展现形式,一般是对基因id的计数居多。如果是对数据做求和计算,可以通过点击“Σ值”里面的选项后面的箭头进行设置,如下:
该项统计只支持精确统计,必须完全匹配,若有空格或字符数字的差异均采用不同的项进行计数。
2、函数:countif sumif (难度高)
Countif是指对指定条件的单元格进行计数(单条件计数),语法如下:
=COUNTIF(range,criteria)
参数range 表示条件区域——对单元格进行计数的区域。
参数criteria 表示条件——条件的形式可以是数字、表达式或文本,甚至可以使用通配符。
Sumif是条件求和函数,语法如下:
=SUMIF(range,criteria,sum_range)
参数:Range为条件区域,用于条件判断的单元格区域。
参数:Criteria是求和条件,由数字、逻辑表达式等组成的判定条件。
参数:Sum_range 为实际求和区域,需要求和的单元格、区域或引用。
标记基因和目的基因是连在一起的。
用标记基因筛选基因载体的方法很简单,在表达载体上一般有两个甚至两个以上的标记基因,比如,一个是抗青霉素的基因,一个是抗四环素的基因,将目的基因插入到抗四环素的基因中,那这个表达载体就不能表达出抗四环素的性状了,只能表达出抗青霉素的性状。然后,将表达载体放在含青霉素的培养基上培养,那么,凡是含有表达载体的就能存活下来。
然后将这些能抗抗青霉素的菌落放在含四环素的培养基上,不能存活下来的就是我们所需要的。
具体方法是印章法。也就是用一块无菌的增绒布,在含青霉素的培养上印一下,接种到含四环素的培养上,如果那个菌落不能生长,那就是我们所需要的,然后从含青霉素的培养基中选择。
利用基因表达载体上的标记基因筛选:
例如:标记基因是四环素抗性基因,就用含有四环素的培养基培养活细胞,如果细胞活着,证明基因表达载体已经进入。
不存活,表明没有进入受体细胞。
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