1种类不同。内资公司包括有限责任公司和股份有限公司;而普通企业除了内资公司外，还包括个人独资企业、合伙企业、非公司企业法人等。2法律地位不同。内资公司属于法人，具有法人资格，具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务;而普通企业不一定具有法人地位。
法律依据：
《中华人民共和国企业法人登记管理条例》
第二条具备法人条件的下列企业，应当依照本条例的规定办理企业法人登记：
(一)全民所有制企业;
(二)集体所有制企业;
(三)联营企业;
(四)在中华人民共和国境内设立的中外合资经营企业、中外合作经营企业和外资企业;
(五)私营企业;
(六)依法需要办理企业法人登记的其他企业。
第七条申请企业法人登记的单位应当具备下列条件：
(一)名称、组织机构和章程;
(二)固定的经营场所和必要的设施;
(三)符合国家规定并与其生产经营和服务规模相适应的资金数额和从业人员;
(四)能够独立承担民事责任;
(五)符合国家法律、法规和政策规定的经营范围。
第十七条企业法人改变名称、住所、经营场所、法定代表人、经济性质、经营范围、经营方式、注册资金、经营期限，以及增设或者撤销分支机构，应当申请办理变更登记。
内资公司就是指采用公司制的内资企业，包括以国有资产、集体资产、国内个人资产投资创办的公司制企业。
内资公司与普通企业的区别包括以下几个方面：
一、种类不同。内资公司包括有限责任公司和股份有限公司；而普通企业除了内资公司外，还包括个人独资企业、合伙企业、非公司企业法人等。
二、法律地位不同。内资公司属于法人，具有法人资格，具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务；而普通企业不一定具有法人地位，如个人独资企业、合伙企业不具有法人资格。
三、登记法律不同。内资公司登记的法律依据为《中华人民共和国公司登记管理条例》、《中华人民共和国公司法》等，而普通企业登记的法律依据除了上述法律法规外，还包括《个人独资企业登记管理办法》、《合伙企业登记管理办法》等。
参考资料来源：
百度百科-内资公司
百度百科-企业
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