长江口位于上海市北部，从江苏江阴的鹅口鼻到出海口的吉谷礁，全长约232公里。长江口平面呈喇叭状，窄口宽5.8公里，宽口宽90公里。长江最终流入崇明岛以东的东海，黄河流入渤海。
长江干流在长江口的一段，其主要支流包括黄浦江、柳河和李安琪河。它是河流的一个分支，被岛屿和沙洲分开。主要由北支、南支、北口、南口、北槽、南槽组成。现代地理形势终于在20世纪初形成，并且还在继续延伸。它是长江口通向大海和远洋运输的门户。水路港口众多，为上海和江苏东部的经济繁荣奠定了基础。进入20世纪以来，长江口地区发展迅速，逐渐成为中国发展最快的地区之一。
长江口西端宽约9公里，东端从启东口接至南汇嘴口，江面宽90公里。在河流和东海涨潮的相互搅动下，泥沙不断淤积，形成了崇明、长兴、横沙口的沙岛，无数的浅滩、暗沙。崇明岛将长江分为两条水道:长江口北支逐渐变窄，水咸，航道淤积浅，航运价值日益降低；长江口南支由长兴岛和横沙岛分为南槽和北槽两个分支。南航道以九段沙为界分为南航道和北航道。南港水道入海最浅处约7米深，是海船进出上海的唯一通道。
