芒康县平均海拔4317米。
芒康县位于西藏自治区东南部，昌都最东端，川滇藏三省交汇处。东邻四川省巴塘县，南接云南省德钦县，西接左贡县，北接贡觉县、察雅县。
芒康县的地形比较复杂。横断山脉从北到南贯穿全县，而宁静山是主要山脉，从北到南。此外，这里还有许多其他山峰，如达拉内峰、达马亚峰、卡齐西卡冲峰、达拉内峰、王秋占堆峰等。此外，芒康县属高原温带半湿润季风气候，夏季潮湿，冬季寒冷干燥。
