南海九段线与纳土纳群岛附近海域重叠。
南海问题错综复杂，不仅涉及领土主权争端，还涉及海洋权益争端。不仅有中国与越南、菲律宾、马来西亚、文莱的争端，还有菲律宾与马来西亚对沙巴的主权争端。因为东南亚国家各自延伸《海洋法公约》做出自己有利的解释，所以普遍存在所谓大规模专属经济区重叠的现象。
由于各国对海洋权益的重视程度不同，经济专属区内的争端时而紧张，时而缓和。中国和印尼在纳土纳群岛和九段线的渔业资源争端就是这些问题之一。虽然中国和印尼之间不存在领土争端，但为了扩大在南海的影响力，获取更多的经济利益，印尼近年来频繁扣押他国渔船，理由是其“专属经济区”渔业资源被他国非法捕捞。此前，曾发生过中国渔船在南海九段线被印尼执法船扣押的事件，中国海警船紧急追捕解救。
然而，在南海争端中，并不是所有国家都像中国一样克制行事。4月27日，印尼和越南在纳土纳群岛西北海域发生激烈冲突。一艘越南渔船沉没，12名渔民被印尼扣押，两名越南渔民跳海。对峙期间，越南渔政船直接撞上了印尼护卫舰。
法新社4月29日报道称，印尼和越南上周六因南海非法捕鱼发生冲突。印尼海军发布现场视频，称其护卫舰KRI·吉帕蒂号(381)在纳土纳群岛西北约161海里处拦截一艘越南渔船时，被两艘越南渔政船(KN-231，KN-264)拦下。对峙期间，越南船只恶意撞击印尼军舰。
事件导致越南渔船沉没，12名渔民被抓，两名越南渔民跳海逃生，被本国渔政船救起。4月29日，印尼外交部召见越南大使提出抗议。印尼外交部表示，“事件发生在印尼专属经济区，印尼拥有开发资源的专属权利。越南渔政船采取的行动危及两国士兵的生命，不符合国际法和东盟精神。”
印尼和越南船只相撞地点
纳土纳群岛位于南海南端，毗邻南海九段线，越南也主张这片海域的专属区。印尼海军没有详细说明越南渔船沉没的原因，只是表示可能是因为意外碰撞而沉没。视频显示，越南渔政船从左侧撞击印尼护卫舰，印尼海军士兵持枪。在碰撞过程中，越南船只的右舷明显受损。随后，印尼士兵用木棍砸碎越南船只上的设备，并高喊“狗”“猪”等侮辱性词语。
作为世界上最大的群岛国家，印尼近年来加强了对本国专属经济区的专属管辖权。2017年，印尼将南海南部更名为“北纳土纳海”。2014年以来，已有数百艘越南、菲律宾、中国等国家的渔船在这片海域被抓扣。印尼海军动用军舰炸毁被扣他国渔船。
印度尼西亚西部舰队司令少将·尤多·马戈诺说，被抓获的12名越南渔民正在印度尼西亚海军基地等待法律诉讼。两名跳海的越南渔民被越南船只救起后逃离。
这一事件是印尼加强对南海南部管辖权的最新行动。印尼渔业部长苏西·普吉亚斯图蒂29日宣布，印尼销毁他国“非法捕捞”船只的做法已经暂停数月，但最新的冲突促使印尼恢复了这项行动。印尼将于5月5日再次炸毁51艘外国渔船，主要来自越南。
目前尚不清楚事发海域是否位于南海九段线以内。除了动用军事力量在附近海域执法，印尼还在纳土纳群岛新建了军事基地。中国多次抗议印尼在南海的单方面行动。
