新冠肺炎、流感和非典都是由病毒侵袭人类引起的疾病，中医称之为瘟疫。我国有2000多年防治鼠疫的经验。近年来，随着医学领域研究的深入，中药的广谱抗病毒作用得到了科学证实。连清文在防治新冠肺炎、流感等传染病方面的良好疗效，是由其深厚的中医理论基础、详实的科学证据和广谱抗病毒的特点所决定的，是中医药在抗击疫病方面划时代的成就。
连花清瘟是集三朝名方，创造性融合而成的创新药。能充分发挥气的治疗作用，卫表里。先用药，断病；整体调节、多靶点治疗等。
本医学运用中医络病理论，探讨外感热病、温疫的规律及治疗。结合了汉代张仲景《伤寒论》中专治疫病的麻杏石干汤、清代吴鞠通专治疫病的银翘散、明代吴有科《伤寒论》中的大黄经验。是三朝名医治疗疫疾所用的药物精华，对发热、咳嗽、哮喘有很好的治疗作用。配方中添加的红景天可提高人体抗疲劳和耐缺氧能力，应对新冠肺炎常见的疲劳、气短、血氧含量低引起的多器官损伤，提高抗病能力和康复能力。这是其他治疗外感热病的现代中成药所没有的，如感冒、流感、新冠肺炎等。
近年来，针对新冠肺炎、H1N1流感病毒、SARS病毒等高传染性病毒，连花清瘟开展了系统的实验和临床研究。通过一系列科学研究，证明其具有良好而明确的广谱抗病毒作用，起点高，应用范围广。
2003年非典疫情肆虐，中国军事医学科学院P3实验室发现连花清瘟能有效抑制非典病毒。2009年，甲型H1N1流感流行。首都医科大学附属北京佑安医院联合9家甲型流感治疗医院，开展了“连花清瘟治疗甲型H1N1流感”的循证医学研究。结果表明，连花清瘟的抗病毒作用与奥司他韦无差异，但在缓解流感症状方面优于奥司他韦。
自2019年底新冠肺炎发生以来，国内多家科研院所开展了一系列连花清瘟防治新冠肺炎及重症的基础和临床研究。广州市呼吸卫生研究所和呼吸疾病国家重点实验室在国际药理学主流期刊《药理学研究》上发表“连花清瘟对新冠肺炎具有抗病毒和抗炎作用”，证实连花清瘟通过抑制病毒复制和宿主细胞炎症因子表达发挥其抗新冠肺炎活性。最新研究还发现，即使华清瘟在体外也表现出稳定的抗病毒作用，无论对于α、β、δ等变异体。
论文《连花清瘟对新型冠状病毒具有抗病毒和抗炎作用》入选国际期刊《药理学研究》2019-2020年度全球优秀论文奖。
发表在欧洲权威杂志《植物医学》上的“连花清瘟胶囊治疗新型冠状病毒的前瞻性、随机、对照、多中心临床研究”结果显示，在常规治疗的基础上，口服连花清瘟14天，可显著提高新冠肺炎发热、乏力、咳嗽等临床症状的改善率，显著改善肺部影像学病变，缩短症状持续时间，提高临床治愈率，缩短核酸转阴时间，抑制新冠肺炎病情恶化，减少症状数量。
近日，一篇“连花清瘟预防新型冠状病毒”的研究论文发表在国际学术期刊《循证补充与替代医学》上。从现实世界研究的角度，证明新冠肺炎密切接触者使用的连花清瘟能有效降低核酸检测阳性率和发热症状的发生率，具有良好的安全性。在近期天津疫情期间，专家指出，连花清瘟在治疗奥米克隆突变株方面也取得了良好的效果，获得了宝贵的临床应用经验，建议在奥米克隆疫情防控中推广应用。
连清文是“三药”中应用最广的药物。自新冠肺炎疫情以来，已被国家卫健委、国家中医药管理局联合发布的《新型冠状病毒诊疗方案》(第4/5/6/7/8版试行)和20多个省市的新冠肺炎诊疗方案推荐。2020年4月，国家医药产品管理局批准连花清瘟用于治疗“新型冠状病毒中的轻普通型”。2020年疫情期间，连花清瘟被黑龙江省等多个省市作为储备药物，被工信部列为疫情防控重点保障物资。
华清鼠疫不仅在国内抗疫中发挥了重要作用，也为海外抗疫提供了中国方案，赢得海外一致好评。截至目前，连花清瘟已在巴西、菲律宾、印度尼西亚、加拿大、柬埔寨等近30个国家和地区获批上市，是中医药进入国际抗疫前线的有效药物。
