菊粉是果糖通过β-1,2连接形成的线性直链多糖,末端有一个葡萄糖,聚合的DP通常在2-60之间。菊粉实际上是多种聚合度不同的果聚糖的混合物。聚合度低(DP = 2 ~ 9)的果聚糖通常称为低聚果糖,聚合度10 ~ 30的果聚糖通常称为多聚果糖。工业化的菊糖主要是从菊苣中提取精制而成,而低聚果糖则是通过酸解或酶解菊糖而从菊糖中制得。