秸秆罐换水是一个非常重要的环节，会直接影响罐内生物的生存条件和水生植物的生长。一般以每周更换1/5-1/3的秸秆罐水为宜。换水后，自来水中的余氯可以通过各种方式去除。(一般可以事先或事后加入水质稳定剂或脱氯剂)。换水的时候，可以进行一些水族箱清洗、更换过滤棉、玻璃清洗、添加肥料和硝化细菌。
秸秆罐换水的正确方法
准备一根足够长的一般软水管，一端放在屏幕上，然后拿一个锁扣和一个大一点的夹子。将夹子放在锁扣上，然后将锁扣放在固定屏幕的一端。(当然选择的锁比水管略小)。换水时，先将带网的一端放入水中，然后将夹子夹在玻璃边缘固定。然后把另一端放在水龙头上，打开水龙头看现有的水流入水族箱，再把套在水龙头上的水管拔出来。由于虹吸原理，水族箱里的水会自然分流出去。当水族箱中的水位达到要求的高度时，可以再次向水族箱中放水，直到达到换水前的高度。整个换水过程不需要10分钟，所以简单多了！
夏天热水中的溶解氧比夏天低，要多换水，冬天可以相应减少。根据经验，夏天藻类特别容易滋生。可能是高温促进了水生生物的新陈代谢，导致更多的营养物质被释放到水中。所以要多换水。冬天换水的时候，因为水温比较低，水要慢慢流入水族箱，这样水温不会变化太大。也可以分几次少量换水(因为不能像水族箱一样先调好水温再加入水族箱)。
换水注意事项:
除了修剪水草缸，平时换水也很重要，尤其是换水时，要注意以下事项:
1.换水前，最好对新水进行提前处理(空气暴露-消除水中的氯，水的消毒灭菌-消除藻类孢子、致病菌和细菌等。).
2.注意换水时的水温控制，尤其是冬天，换水速度要慢，一次换水不要太多。
3.换水的时候，比如清洗滤料的时候，用缸内更换的水冲洗，不破坏滤料内的生态。
4.换水时，建议停用过滤器使水流静止，然后清洗水箱，如去除藻类(以免藻类随水流灌满整个水箱)。
5.更换新滤料不应与换水同时进行，应添加EM。
6.换水时，增加淡水的出口，避免在红色水草等敏感水草之上，以免水质改变，导致水草停止生长。
