1.大多数先天性肝囊肿不需要治疗，只需要定期观察。部分患者生长迅速，囊肿较大，有感染和症状需要治疗。
2.对于较小的囊肿，通过穿刺注入无水酒精，破坏囊肿的上皮细胞，使其不再产水，囊肿就不会长大。
3.对于较大的囊肿，可采用微创手术(腹腔镜)在囊肿上开一个洞，使水引流至腹腔并被吸收。
