六门东厂的锦衣卫有几个主要区别。
1.不同的机构。
明清门分别指刑部、大理寺、都察院。锦衣卫是明朝专属的军政搜集情报机构，前身为明太祖朱元璋设立的“龚伟司”，后改名为“亲军杜威府”，辖有仪鸾司，掌管皇帝仪仗职责和护卫。东，官方签名。即中国明代的特权监察机构、特务机构、秘密警察机构——东极石厂。
2.成立时间不同。
明朝万历年间，为了处理与国家大事有关的案件，朝廷设立了集武功高手、特务、捕快、杀手于一身的秘密组织。因为这个组织的秘密性质，也因为总部的正殿是一个六门建筑，每边有两个门分别朝南、东南和西方，所以被称为“六门”。
吴十五年(1382年)，朱元璋设锦衣卫。最初的作用有三:一是守护黑夜；第二，侦察逮捕；第三，监狱法。一段时间以来，没有建立稳定执行这三项职能的制度。
明宪宗为加强特务统治，于成化十三年(1477年)在东厂外设立西厂，与东厂、锦衣卫合称为厂卫。宦官知望被任命为提督，其权力超过了东厂，其活动范围从首都遍及全国。遭到反对后，被迫退出。郑德元年短暂重开五年后，又被撤销。
永乐十八年(1420年)，成祖设立东厂(简称东厂)，由一名亲信宦官领导。常东是世界历史上最早建立的国家间谍情报机构，其分支远达朝鲜半岛。
3.工作内容不一样。
“六门”通常只接手江湖上的帮派斗争和政府长期通缉的要犯。锦衣卫作为皇帝侍卫的军事组织，主要职能是“掌管侍卫、巡捕”，从事侦察、逮捕、审问等活动。他还参与收集军事情报和对敌方将领进行暗算的工作，如在万历朝鲜战争中收集大量日军军事情报。东厂的权力凌驾于锦衣卫之上，只对皇帝负责。不经司法机关批准，可以随意监管和逮捕臣民，从而开启了明朝宦官执政的终结。
