云南是中国高等被子植物特有属丰富、生物多样性高的地区。云南植物区系丰富，有种子植物240科，1984属，约13000种。无论哪种分类学家的系统或观点，云南都有许多古老或原始的科属。
从云南种子植物属的15个分布类型的比较分析来看，云南植物区系具有明显的热带性，并富含温带成分。热带属占云南总属数的61.89%，温带属占32.19%。云南有中国特有属约83属，占云南总属数的4.39%，占全国224个特有属的37.05%。
中国特有属的三个分布中心中有两个位于云南，即滇西北和滇东南。云南特有属有爵床科爵床科宽叶爵床、毛菊苣、毛菊苣、唇形科胡颓子根、茜草科徐长卿、伞形科云南刚竹、昆明芹。
