长崎市内有五条有轨线路。由长崎电气轨道运营，有轨线路可以到达长崎市大部分的主要景点。电车从6:00 到23:00每5-8分钟发车。乘坐有轨电车要从後门上车，前门下车，下车时付费。不管行程多远单程都是120日元。可以购买500日元的一日周游券，使用它可以在一天之内不限次的使用有轨电车。
有轨电车线路在两个任意站点之间几乎不需要转车。只有在筑町站有时需要在线路1与线路5之间转车。因此，转车的乘客可以在筑町站下车时在出口领一张转车票，这样就不用支付两次，在第二辆车下车时出示转车票。 长崎还拥有城市巴士网络，由长崎巴士和长崎县营巴士运营。不过，一般的游客除了去稻佐山以外一般都不喜欢乘坐巴士。
要2个小时或2个半小时。根据查询地图相关显示，东京到长崎新干线坐飞机要2个小时或2个半小时，夜行电车要14小时，夜行大巴没有直通，需要在福冈转乘，加起来15小时。日本的西九州新干线又被称为长崎新干线，是一条连结博多站至长崎站、属于九州旅客铁道(JR九州)公司的高速铁路线。
