什么是转录组分析

转录组

是指某个物种或特定细胞在某一生理功能状态下，细胞内所有转录的mRNA产物的集合，包含了时间

和空间

的限定，是连接

基因组

遗传信息与生物功能的

蛋白质组

的必然纽带。转录水平的调控是

目前

研究最多的，也是生物体最重要的调控方式。

应用高通量技术进行转录组测序是一种快捷可靠的获取转录组信息的方法。mRNA的转录本表达分析，通过获得研究对象基因组转录区域的信息，鉴定转录发生

位点

，可变剪切等，其精确的计数方法更可对基因进行精确的定量分析。

转录组分析总体流程如图所示，主要分为上游分析（原始数据质量控制、比对、组装、定量），下游分析（差异分析、富集分析）和高级分析（共表达分析、GSEA、时序性分析等）。整个流程图左侧为结构分析（SNV分析、可变剪切分析、差异外显子分析（DEU）及新转录本鉴定），右侧主要为基因表达分析。

随后的文章都是使用GSE176393（SRP323246）进行。

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