一、含义不同
1、定根是发生于植物体的固定部位，包括主根和侧根。
2、不定根是从嫩枝、枝条、地上茎、地下茎和老根上形成的根。
二、位置不同
1、定根有一定的发生位置，如主根由胚根发育，侧根在主根的一定位置侧向生出。
2、不定根的发生位置不固定，可以从茎、叶、老根等发出。
三、发育来源不同
1、定根中的主根是由胚根直接发育而成，侧根是在主根生长到一定长度时，在一定部位侧向从生出的许多支根。
2、不定根是由根原基发育而来的。
单子叶植物的根有些象人的胡须一样，没有主根，所以把它称做为须根系。它是由种子根和不定根组成的。所以须根系主要是由不定根组成的。例如小麦就算是须根系。由胚根生长形成的一条主根就是种子根，在幼苗期起吸收水分和支撑作用，一般在不定根形成以后就逐渐枯死。不定根是从茎节上生出的，在每个未伸长节间的茎节上都会长出若干条不定根，且越向上的茎节上长出的根越粗，数量也越多，伸长节间的茎节上不再长根。
就是说有些植物的根不是直接或间接由胚根所形成，而是从茎、叶或其它部位生长出来，没有固定的生长部位，所以称为不定根。不定根有扩大植物吸收面积和增强固着或支持植物的功能。在组织培养中，由愈伤组织长出的根，也称不定根。不定根的发生是由于植物器官受伤或激素、病原微生物等外界因素的刺激，因此表现为植物的再生反应。特别是在受到机械创伤与水份的厌氧胁迫时，植物会在形态学下端的受伤部位或水淹的水陆交界处形成大量的不定根。例如剪取一段垂柳枝条，插在潮湿的泥土中，不久在插入泥中的茎上长出了根，这就是不定根。一个水仙头，放在水中没几天，在它的底部密集地生出一环根，这也是不定根。在林业和园艺上，对柳树、葡萄、月季、秋海棠等植物的枝条扦插、叶插或压条等营养繁殖中，均能产生大量不定根。
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